Master 1 de Chimie, parcours
Chimie Biologie, Orsay


Sélectivités en synthèse organique et chimie organométallique : Chim 430 (48 h, 5 ECTS)

ORGANOMETALLIQUES (10,5 h Cours, 10,5 h TD)
Propriétés des complexes
Réactions fondamentales
Applications stoechiométriques et catalytiques en synthèse organique

OXYDATIONS, REDUCTIONS, GROUPEMENTS PROTECTEURS (6 h Cours, 6 h TD)

PRODUITS NATURELS (4,5 h Cours)

SYNTHESES MULTIETAPES (7,5 h TD)

MODELISATION MOLECULAIRE (3 h Cours)

Enseignants :
V. Gandon, Professeur, Université Paris-Sud, ICMMO.
C. Kouklovsky, Professeur, Université Paris-Sud, ICMMO.
C. Aroulanda, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.
V. Alezra, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.
S. Bezzenine, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.
N. Rabasso, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.

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Les réactions fondamentales pour la construction des architectures carbonées : Chim 431 (51 h, 5 ECTS)

Réactions via des énolates et des énamines
Formation des énolates, structure électronique, régiosélectivité et contrôle de la configuration Z/E, influence du solvant et du cation sur la formation de énolates
Alkylation
Enamines et métalloénamines
Aldolisation

Réaction de Michaël
Addition de Michaël / addition sur les accepteurs de Michaël
Annélation de Robinson et réactions apparentées
Stéréosélectivité de la réaction d'aldostérone et réactions apparentées

Réaction de Mannich
Synthèse des bases de Mannich
Réactions apparentées : Polonovski-Potier, Robinson-Schöpf, Pictet-Spengler et Bischler-Napieralski

Réactions péricycliques
Règles de Woodward-Hoffmann

Réactions électrocycliques

Réarrangements sigmatropiques
Transpositions de Cope et de Claisen, réarrangement (2,3)

Cycloadditions
Réactions de Diels-Alder inter et intramoléculaires
Réactions d'hétéro-Diels-Alder
Cycloaddition dipolaires (2+3)
Cycloadditions photochimiques

Ene et métalloène réactions

Réactions en série hétérocycliques

Synthèse multiétapes

Enseignants :
C. Kouklovsky, Professeur, Université Paris-Sud, ICMMO.
V. Alezra, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.

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Méthodes d'analyse moléculaire : Chim 432 (54 h, 5 ECTS)

Chromatographie (12 h cours et TD)
Théorie simplifiée de la chromatographie
Chromatographie en phase gaz et chromatographie liquide haute performance
Chromatographie ionique et d'exclusion stérique
Optimisation d'analyse / analyse quantitative

RMN (9 h cours, 9 h TD)
RMN 1H - couplage et stéréochimie - noyaux échangeables - effet des équilibres chimiques sur les spectres - phénomène de découplage - analyse de spectre du second ordre
RMN 13C - découplage large bande - découplage hors-résonance - introduction aux phénomènes de relaxation - effet Overhauser nucléaire
RMN 2D - séquences d'impulsions - méthodes DEPT, COSY, NOESY et INADEQUATE

Spectrométrie de masee (12 h cours, 12 h TD)
Description des principales méthodes d'ionisation : impact électronique, ionisation chimique, ionisation par électronébulisation, ionisation-désorption laser
Principes d'interprétation des spectres de masse et applications à la chimie organique

Enseignants :
F. Berruyer, Docteur, Université Paris-Sud, LCP.
I. Billault, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.
G. Bouchoux, Professeur, Université Paris-Sud, Polytechnique.
A. Meddour, Docteur, Université Paris-Sud, ICMMO.
D. Merlet, Professeur, Université Paris-Sud, ICMMO.

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Structure et fonctionnement des macromolécules biologiques : Bio1 (50 h, 5 ECTS)

L'univers des protéines
Analyse de l'architecture des protéines
Stabilité des protéines
Repliement des protéines

Quelques grandes familles de protéines : structure 3D, évolution, mode d'action et de régulation
Les protéases et leurs inhibiteurs
Les kinases et lers protéines kinases
Les protéines G et les switches moléculaires
Les déshydrogénases à NAD
Les aminoacyl tRNA synthétases

Enseignants :
S. Duqueroy, Docteur, Université Paris-Sud, Institut Pasteur.
D. Liger, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.
P. Minard, Professeur, Université Paris-Sud, IBBMC.
S. Nessler, Professeur, Université Paris -Sud, LEBS.
T. Touzé, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.
H. van Tilbeurgh, Professeur, Université Paris-Sud, IBBMC.

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Méthodes d'études des protéines : Bio2 (50 h, 5 ECTS)

RMN
Introduction à la RMN 2D et 3D
Résolution des structures de protéine par RMN

Fluorescence
Bases théoriques et applications

Cristallogenèse et diffraction
Résolution de structures par dérivés lourdss

Microscopie électronique

Enseignants :
H. van Tilbeurgh, Professeur, Université Paris-Sud, IBBMC.

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Enzymologie : Bio3 (70 h, 5 ECTS)

TP d'enzymologie de deux semaine
Cette UE a lieu sous la forme d'un stage intensif directement relié à une étude de problèmes concrets de mesure d'interactions et de cinétique enzymatique. Les thèmes abordés, pouvant varier d'une année à l'autre, sont issus des problématiques des laboratoires de recherche de l'IBBMC. L'accent sera mis sur la conception et l'analyse critique des procédures expérimentales. L'objectif sera d'abord de détailler puis de valider la conception des protocoles de mesure en tenant compte des contraintes des systèmes étudiés.

Enseignants :
D. Liger, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.
A. Urvoas, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.

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Expression, purification et caractérisation de protéines recombinantes : Bio4 (70 h, 5 ECTS)

TP de biologie moléculaire et de biochimie (50 h)
L'objectif de cette UE est de mettre les étudiants en situation d'un projet de recherche en laboratoire. Ces travaux pratiques se déroulent sur deux semaines et se présentent sous la forme d'un mini-stage de recherche dans le domaine de l'ingénierie des protéines, en association à une équipe de recherche. LEs techniques utilisées inclueront des outils de criblage (immunodetection par fluorescence), du clonage de gènes, l'expression deprotéines recombinantes dans E. coli, leur purification, l'étude de leurs propriétés d'interactions (ELISA, Dot-Blot) et l'analyse de données biophysiques (dichroïsme circulaire, microcalorimétrie, structure 3D).

TD de biologie moléculaire et de biochimie (20 h)
Une partie de cette UE se déroule sous la forme de TD ce qui permet aux étudiants d'apprendre à exploiter et présenter des résultats d'expériences.

Enseignants :
M.-B. Valerio-Lepiniec, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.
A. Urvoas, Docteur, Université Paris-Sud, IBBMC.

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